中心重視實驗教學方法和手段的研究，根據不同學科、不同專業、不同實驗項目的特點，采用不同的實驗方法，建立了以專業技術能力訓練為基礎、以綜合業務處理能力訓練為拓展，以創新決策能力訓練為提升的分層訓練實驗模式，為學生開展自主訓練、合作式訓練、研究式訓練提供廣闊平臺。

在自主訓練中，學生通過聽講座后自己運用網絡教學平臺、實驗教學軟件按照試驗要求自主進行試驗，然后借助網絡論壇與教師進行交流，從而解決問題，完成實驗。

合作式訓練采取小組協作的形式，將學生分為若干組，共同按照實驗要求進行不同的角色扮演，并在教師的指導下完成試驗。

研究式訓練通過團隊實戰演習等方式，使學生在模擬客觀實際的實驗室中進行綜合業務處理和決策演練，從而提升其創業意識和創新意識。

中心建立了科學系統的實驗教學考核評價辦法，對不同課程、不同的實驗類型、不同實驗階段分別實施過程考核、結果考核和會診考核，通過綜合考核實驗過程和實驗結果，激發學生的實驗興趣，提高了其實驗能力。