1981年，國務院批準開通西安至香港航線，設立西安航空口岸，同時批準設立西安海關。1984年5月1日，西安海關正式開關。關區范圍最初為陜甘寧青四省區，1989年9月調整為陜西省。 　西安海關是一個內陸海關，誕生于改革開放，又服務于改革開放，并在改革開放中不斷發展壯大。建關23年來，隨著陜西地區對外開放的不斷擴大，西安海關的業務量、工作量迅速增長，機構人員也不斷擴充。目前，西安海關共設15個處（室），2個隸屬海關（西安咸陽機場海關、寶雞海關）和1個緝私局，現有干部職工280名，其中大專以上文化程度占96.4%。

　在海關總署和陜西省委、省政府的正確領導與親切關懷下，西安海關堅持貫徹執行黨的基本路線和各項方針政策，依法行政，為國把關，服務經濟，促進發展，為支持和保障陜西省的對外經濟、文化、科技交流和地方經濟的發展進行了不懈努力，做出了積極貢獻。1985年至2006年，共為國家征收稅款134億元，其中2006年征繳14.6億元，為歷史最高。與此同時，西安海關認真貫徹執行國家有關進出口稅收的優惠政策，累計為我省企事業單位審批減免稅192.9億元，有力地支持了企業技改和科研事業。

　自1998年7月全國打擊走私工作會議召開以來，西安海關積極推進新的緝私體制建設，始終保持打擊走私的高壓態勢，推動了全省反走私斗爭的深入開展，有效地遏制了走私從沿海沿邊某些地區向陜西蔓延的勢力。