武漢海關座落在漢口沿江大道，管轄范圍為湖北全省，下設副廳級機構1個，內設處級機構12個，派駐及隸屬處級機構9個，處級事業單位2個。現有干部、職工500多人。
　　海關是國家進出境監督管理機關，實行垂直領導體制。武漢海關是海關總署的直屬單位，屬于中央事權，主要職責：稅收征管、打擊走私、通關監管、加工貿易及保稅監管、海關統計、海關稽查。
　　近年來，武漢海關在海關總署的正確領導下，堅持以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，全面貫徹落實科學發展觀，按照“依法行政，為國把關，服務經濟，促進發展”海關工作16字方針和“政治堅強、業務過硬、值得信賴”海關隊伍建設12字要求，在各級部門大力支持下，深化改革，整合創新，把關服務能力不斷增強，干部隊伍整體素質進一步提升，各項工作取得了較好成績。
　　武漢海關以促進中部崛起為己任，積極促進湖北外向型經濟的發展。2009年，在國際金融危機嚴重影響我國外貿進出口的情況下，積極主動為地方企業做好服務工作，各項業務指標保持了量減質不減。稅收實際入庫80.6億元，同比下降10.3%，列全國海關第18位，居內陸海關首位。
　　辦理減免稅10.05億元，同比下降61.9%；審核進出口報關單13.99萬份，同比增長8.8%；監管進出口貨運量1002萬噸，同比下降47.7%，進出口貨運總值142.8億美元，同比下降10.8%；監管進出境旅客20.8萬人次，監管進出境行郵物品、快件145.6萬件；實施各類便捷通關措施，提高通關時效，進口平均海關作業時間3.74小時，同比提速51.11%，出口0.55小時，同比提速47.62%。備案加工貿易合同2195份，加工貿易實際進出口金額達48.3億美元，增長12.3%。